疲勞壽命設計由波紋補償器的失效類型及原因分析可以看出，波紋補償器的平面穩定性、周向穩定性及耐腐蝕性能均與其位移量即疲勞壽命相關。過低的疲勞壽命將會導致波紋補償器穩定性及耐蝕性能下降。根據試驗和使用經驗，用于供熱工程的波紋補償器疲勞壽命應不小于1000次。
大多數波紋補償器的失效是由外部環境腐蝕造成的，因此在進行補償器的結構設計時，可考慮隔絕外部腐蝕介質與波紋補償器的接觸。如對于外壓軸向型補償器可在出口端環與出口管之間增加填料密封裝置，其作用相當于套筒補償器，既可抵擋外部腐蝕介質的侵入，又給波紋補償器增加了一道安全屏障，即使波紋補償器破壞，補償器還可以起到補償作用并避免波紋補償器失效。