真空式結晶器與蒸發式結晶器的區別是前者真空度更高，要求操作溫度下的飽和蒸汽壓({jd1})與該溫度下溶液的總蒸汽分壓相等。操作溫度一般都要低于大氣溫度或者{zg}是接近氣溫。真空式結晶器的原料溶液多半是靠裝置外部的加熱器預熱，然后注入結晶器。當進入真空蒸發器后，立即發生閃蒸效應，瞬間即可把蒸汽抽走，隨后就開始繼續降溫過程，當達到穩定狀態后，溶液的溫度與飽和蒸汽壓力相平衡。因此真空結晶器既有蒸發效應又有制冷的效應，也就是同時起到移去溶劑與冷卻溶液的作用。溶液變化沿著溶液濃縮與冷卻的兩個方向前進，迅速接近介穩區。